子宫内膜增生的癌变率发生在40岁以上的女性比较高，所以这些患者不能仅靠药物治疗，要用手术切除子宫才行。治疗的前提是明确病因。如果子宫内膜增生还伴有多囊卵巢、卵巢功能性肿瘤、其他内分泌功能紊乱等症状，就应该进行针对性的治疗。年轻的患者则可以先考虑药物治疗。一般药物治疗分为西医药物治疗及中医药物治疗两种，西医中主要针对子宫内膜增生治疗的药物为促排卵药物氯米芬和孕激素类药物。西医药物的使用、疗程必须要在医生的指导下进行，并且注意对药物是否有不良反应。
在中医药物中，临床上一般选择中药妇炎丸进行治疗