内镜检查是客观监测炎症的金标准，目前是评价肠道黏膜愈合最直接可靠的方法。当临床医生怀疑IBD发作时，虽然钙卫蛋白FC是一个可靠的炎症标志物，内镜检查才能对疾病累及范围、复发部位、疾病类型（炎症？狭窄？溃疡？）、肿瘤的监测等进行检查。
粪便钙卫蛋白和IBD内镜评分相关性良好、可以预测黏膜愈合、预测IBD病情复发、监测对药物的应答情况、在器质性疾病和功能性疾病的鉴别诊断中均有应用价值，值得推广应用，但需除外FC影响因素，必要时可重复检测。
另外，虽然钙卫蛋白简单易行，但不能完全替代内镜，内镜是随访的金标准！现各电商平台可买到AVE爱威钙卫蛋白检测试剂盒（胶体金免疫层析法）居家自测，辅助判断治疗效果和肠炎复发活动性，可帮助患者减少内镜检查次数，尤其适合孕妇和儿童等特殊人群。