宝宝吃手指采取综合治疗的方法，细菌手指的处理应该采取综合性的治疗，首先要去除病因，例如要及时解除可能引起儿童情绪紧张和焦虑的诱因，缓解对其紧张情绪，安抚父母不要过度焦虑，尤其是四岁以前出现吃手指的习惯，过渡阻止反而会强化孩子的行为，所以应转移婴幼儿的注意力，不要强行制止。
此外还应纠正不良的婴幼儿的喂养，如因饥饿而哭闹时要及时给予喂养，培养入睡习惯时不易过早躺在床上，而应该等待孩子困见时将其放在床上，争取做到上床后很快就能入睡，治疗过程中要注意给予儿童以关爱，避免讥、训斥、嘲笑，鼓励其改掉这种不良的行为。对于难以克服者可采用厌恶疗法，记在其手指上涂抹带颜色的、有味道的、刺激性的物质，当儿童吸吮时变成了厌恶的刺激，感到恶心，可能收到一定的疗效，行为治疗对于年长儿童吸吮手指的行为有较好的矫正效果，如近期吸吮手指的预后是良好的，随年龄的增长会自然消失。