精炼的亚麻籽油因为经过脱色、脱苦等精炼工艺，颜色较浅（浅黄甚至无色），无苦味，烟点也提高了可用来高温炒菜，但这种油在加工过程中几乎破坏了亚麻籽本身所有的营养成分，经过高温和一系列化学反应后的亚麻酸已经没有活性，而且维生素A、D、E等大部分都会消失殆尽，还有化学物质的残留。精炼的亚麻籽油不能为人体补充必须脂肪酸a-亚麻酸以及各种维生素，营养价值低，只能作为一日三餐的调味品。
最好的亚麻籽是低温冷榨亚麻籽油，几乎保留了亚麻籽所有的营养，纯正的亚麻籽油原味不经过化学精炼，味道都是微微苦的，烟点也较低。