引起小儿斜视的原因有很多，常见的原因有如下：
1、发育不完善：断奶、换牙、惊吓等，都可以使大脑的融合功能受到破坏造成斜视。
2、先天异常：这种斜视多由先天眼外肌肉的位置发育异常，眼外肌本身发育异常。也有的由于生产过程中，使用产钳造成婴儿头面部损伤或母亲生产时用力过度致胎儿颅压升高产生大脑点状出血，而出血刚好在支配眼球运动的神经核处引起眼外肌麻痹。
3、遗传因素：遗传因素斜视眼在家族中遗传不是全体成员，这种缺陷往往是间接遗传到下一代子女身上。一般出生6个月内发生斜视称先天性斜视，它不具备建立双眼视物的基本条件，对视功能的发育危害最大。
4、眼球发育特点：由于儿童眼球小，眼轴短，多为远视眼。又因为儿童的眼睛调节力强，想看清物体就需要更多的调节力，同时双眼也用力向内转产生了过量辐辏，容易引起内斜视，这种内斜视称调节性内斜。
如果集合过强或外展不足或两者同时存在就产生了内斜，相反外展过强，集合不足或者两者同时存在，就产生了外斜。
5、特发性的及其他原因：某些疾病也可能导致小儿斜视的发生，如先天性眼睛白内障及其他眼睛的器质性疾病都可能导致小儿斜视。